转录辅助因子对不同子类的核心启动子具有特异性

2022-02-07 02:05:51 来源:

特异性辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与特异性二者之间传播调控线索，是特异性转录和基因表达的内部效应物。虽然已证明某些COF比其他COF越来越一般而言某些特异性子类，但是有所不同COF对有所不同特异性表明成的内在特异性的程度尚能不清楚。在一项新学术研究当中，来自巴伐利亚维也纳生物当的中心分子法医学学术研究院的学术研究职员在黑腹果蝇S2细胞核当中使用生物信息学特异性活性测定来筛选23个COF转录7.2万个候选内部特异性（core promoter， CP）的意志力。相关学术研究结果于2019年5月15日网络服务发表在Nature期刊上，论文原文为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些学术研究职员观察到内部特异性的关联性转录，这说明COF与特定子类的内部特异性二者之间普遍存在着有所不同的缓冲一般而言或者说“完整性（compatibilities）”。这些功能有所不同的内部特异性在TATA盒、三角洲特异性器件（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等已知的序列器件上关联性性地硫化物，并在内源性位点上表明成有所不同的染色质功用。值得注意的是，这些内部特异性子类在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上普遍存在有所不同的比较总质量，这说明这些酪氨酸；也不太可能必须区分反式缓冲因子而不是特异性和增强子子类的顺式缓冲器件。这些学术研究职员证明在人细胞核和另外两种果蝇细胞核当中证明了有所不同COF-内部特异性完整性的普遍存在。为此，他们辨认出了分别一般而言TATA盒和CpG岛特异性的COF。COF和内部特异性二者之间的有所不同完整性必须解读有所不同的增强子如何特异性地转录有所不同组的基因、有所不同基因内的高性能特异性（alternative promoter）和有所不同特异性内的有所不同特异性起始位点。综上所述，COF-内部特异性完整性不太可能是果蝇和人类等有所不同物种当中有所不同特异性程序的基础。零碎成处：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]