Lancet Oncol：肾透明细胞癌与肥胖假设相关的转录组特征分析

2021-12-13 02:13:23 来源:

一.资料统计分析背景

厌食症与脾脏光亮细胞内肺癌 (ccRCC)的几率缩减有关，但厌食症又矛盾地与该的病状有所改善有关，其潜在机制尚不具体。现笔记对厌食症患儿和但会躯型患儿在原发和瘤周胆固醇组成员织里面的静脉降解和特异性核糖体组成员差异性开展资料统计分析统计分析。

本文简介了蛋白质备注达引起的微环境的差异性有助于理解厌食症患儿的求生存优势（厌食症断言）。

二.统计分析流程三.文章讲解1.COMPARZ字段、TCGA-KIRC字段、MSK特异性化疗字段资料采集、矫正

在COMPARZ字段的453名患儿里面，有375名（83％）患儿不具备只用的微阵列资料，化疗当年BMI测量以及无进展和总躯求生存资料开展统计分析（备注1）。除119名（26％）较重患儿均，来自COMPARZ次测试的事与愿违字段都有256名（68％）患儿（n=256）。

备注1.COMPARZ乳肺癌字段的人均收入数学方法和针灸相似性

TCGA-KIRC字段里面的332实有患儿里面，评估了经脾脏切除术化疗的152实有（46％）中期（即AJCC III和IV期）ccRCC患儿的针灸和人均收入数学方法资料（备注2）。在忽略59名（39％）较重患儿后，最后赢取的字段都有93名患儿（n=93）。

备注2.中期光亮细胞内脾脏细胞内肺癌TCGA-KIRC字段的人均收入学和针灸相似性

从62实有MSK外围胆固醇组成员织字段里面开展脾脏脏切除术的非转移性光亮细胞内RCC患儿里面赢取了原发性和外围胆固醇样品。在这个字段里面，从59名患儿的PNN（脾脏周西南方）外围胆固醇，25名患儿的PNA（远离脾脏周）外围胆固醇以及55名患儿的组成员织里面取样。在忽略较重患儿后来，事与愿违字段都有41名（69％）PNN比对患儿， PNA比对为17（68％），比对为37（67％）。从最初的203名作准备者的MSK特异性化疗资料统计分析人一组里面忽略74名（36％）较重患儿后，总求生存统计分析的事与愿违字段都有129名（64％）作准备者（备注3）（n=129）。

备注3. 采用MSK特异性化疗的乳肺癌字段的人均收入数学方法和针灸相似性

2.厌食症的脾脏光亮细胞内肺癌患儿相来得但会躯型的脾脏光亮细胞内肺癌患儿总求生存期短

根据KM求生存统计分析，在四组成员里面都见到厌食症患儿的总求生存期短。在TCGA-KIRC字段里面，经分期解析后，厌食症患儿的总躯存活期常为但会躯型组成员；在COMPARZ字段里面，经IMDC几率评价解析后，胖患儿的总躯存活期也常为但会躯型组成员。在MSK特异性疗法字段里面，经IMDC几率评价解析后，BMI与发病率的无整体差异性（如示意图1）。

示意图1.TCGA-KIRC字段 (A)、COMPARZ 字段(B)和MSK特异性化疗字段(C)的总求生存期

3.COMPARZ字段里面厌食症患儿不具备很好的PFS

对CPMPARZ字段KM统计分析后，KM曲线结果显示，COMPARZ字段里面厌食症患儿比但会躯型患儿不具备很好的PFS。

示意图S1.COMPARZ字段里面厌食症患儿比但会躯型患儿不具备很好的PFS

4.适用中卫药物化疗，厌食症患儿仍不具备很好的OS

KM曲线结果显示了在适用中卫酪氨酸丝氨酸抑制剂（pazopanib或Sunitinib）的两个化疗组成员里面，厌食症患儿的OS仍然较但会躯型患儿好。

示意图S2.COMPARZ字段适用中卫药物化疗组成员的总求生存期统计分析

5.COMPARZ字段里面，厌食症与但会躯型的患儿核糖体组成员蛋白质相似性存在整体差异性

再多上述统计分析，笔记在三个字段里面确认厌食症断言存在后来，几周在COMPARZ字段里面对厌食症和但会躯型患儿评估了核糖体组成员学差异性。先是做了Hallmark蛋白质集的GSEA统计分析，来得厌食症患儿与但会躯型患儿之间的差异性：厌食症患儿里面结果显示间歇性、TGF-β、上皮-间充质转变和静脉降解信号自营整体上调，示意伤口肿胀间接地的激活（示意图A）。示意图B是对示意图A检验的几个蛋白质备注达自营的Enrichment plots。

示意图S4.COMPARZ字段里面厌食症患儿与但会躯型患儿的ccRCC核糖体组成员蛋白质相似性存在整体差异性

6.COMPARZ字段与TCGA-KIRC字段里面厌食症比但会躯型患儿的静脉降解评价很低

在GESA衍生的相似性蛋白质集静脉降解评价来得里面，厌食症患儿很低于但会躯型患儿（如示意图2）。

示意图2.COMPARZ字段(A)与TCGA-KIRC字段 (B)里面厌食症原发患儿与但会躯型患儿的静脉降解的z score

7.但会躯型与厌食症患儿的内皮细胞内一组无整体差异性

对但会躯型(7实有)与厌食症(16实有)患儿的原发的主要内皮细胞内数量均采用流式细胞内术开展评估。示意图A结果显示了厌食症患儿与但会患儿之间的内皮细胞内一组的总躯差异性。示意图B具体结果显示了厌食症和但会躯型患儿T细胞内一组的常为水平。见到但会躯型与厌食症患儿的内皮细胞内一组无相比差异性，内皮细胞内常为的程度与BMI无关。

示意图S9.用流式细胞内术统计分析但会躯型与厌食症患儿的内皮细胞内一组无相比差异性

8.与但会躯型患儿相比，厌食症患儿瘤周胆固醇组成员织上皮细胞缩减，常常是西南方的瘤周胆固醇

在MSK的非转移性ccRCC患儿的当年瞻性字段里面，笔记合并了20个最整体的丰富的IPA规范自营，这些自营来自于厌食症和但会躯型患儿的PNN和PNA比对的来得（示意图A）。厌食症和但会躯型患儿的PNN和PNA比对之间的特异性常为(ssGSEA评价)来得（示意图B）。

示意图S5.与但会躯型的患儿相比，厌食症患儿的脾脏周胆固醇结果显示出上皮细胞和间歇性缩减

综上，在COMPARZ次测试字段里面，经过IMDC几率评价更改后，见到相来得但会躯型患儿，酪氨酸丝氨酸抑制剂化疗提很低了厌食症患儿的几率，值得注意是遵从sunitinib化疗的患儿。IMDC几率评价仿真包含的组成员分间接反映宿主各种因素对肺癌症系统性上皮细胞作用（实有如贫血，里面性白细胞内渐增，和红细胞渐增症），这些各种因素可能也是特异性化疗结果和BMI之间关连性机制的原因。见到厌食症患儿的静脉降解分数很低于但会躯型患儿，与之当年其他的资料统计分析结果备注明的，作准备静脉降解，β-锌间接地等等蛋白质的富集的情形一致。因此，静脉降解的差异性可以其余部分理解厌食症患儿遵从酪氨酸丝氨酸抑制剂化疗后的较高病状。

此资料统计分析为厌食症断言提供了生物学支持。在忧郁症ccRCC的患儿辨别到厌食症患儿相来得但会躯型的患儿微环境的差异性：值得注意是厌食症患儿的的静脉降解缩减，但总躯上皮细胞无相比差异性。格外注意的是厌食症患儿的外围胆固醇结果显示缩减的上皮细胞和间歇性情形。光亮细胞内肺癌与瘤周胆固醇组成员织微环境的复杂化学键可能不具备针灸意义，格外进一步资料统计分析。

原始出处：

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293